Cami 1795 yılında yıkılmış ve 1804 yılında Sultan III. Selim tarafından tekrar yaptırılmıştır. Bu konudaki kitabe cami giriş kapısı üzerindedir.1855 Bursa depreminde büyük zarar gören cami tekrar onarılmış ve bu onarımlar nedeniyle özgünlüğünü büyük ölçüde yitirmiştir.İlk yapıldığında altı kubbeli olduğu belirtilen kare planlı caminin ibadet alanının üzerini şu anda büyük bir kubbe örtmektedir.Son cemaat yerinin tabanları tuğla ile avlu mermer taşla döşelidir.Hamam metruk perişan bir vaziyetteyken 2007 senesinde restore edilmiştir.Külliyenin şu anda mevcut olmayan binalarından Cezeri Kasım Paşa Medresesi, Türbesi ve Aşevi caminin batı kısmında bulunmaktaydı.

2011 yılında yapılan çevre düzenlenmesiyle Emir Sultan Camisi ve Meydanı düzenlenmiş ve insanların rahatlıkla gezebileceği, bir yaşam alanına dönüşmüştür.Emir Sultan Camisi etrafında aile çay bahçeleri bulunmakta ve güzel bir namaz ve türbe ziyareti sonrası güzel sohbetlere konuk etmektedir.

Emir Sultan Camisi gibi diğer bir önemli olan kısım sa Emir Sultan Mezarlığıdır, Cami çevresinde bir çok eski Osmanlıca yazılı taş mezarlar bulunduğu gibi, Emir Sultan Hazretlerine gelenlerin ziyaret ettikleri bir başka mezarda Zeki Müren’in Mezarıdır.

Dikmen Aile Mezarlığının benim için önemi, ilkokulumu yaptıranlar Burhanettin Akıncıtürk ve Ali İhsan Dikmen‘in olması ve Dikmen Aile Mezarlığının burda olmasıdır.Bu hayırsever insanlara Allah’tan gani gani rahmet diliyorum, onların açmış olduğu irfan yuvalarında okumaktan gurur duyuyorum ve bu silsileye ilerde dahil olmak istiyorum.